Sonic, Tails y Amy intentan detener a Eggman, quien tiene secuestrada a Cream. Otros personajes, como Knuckles y Rouge, se encuentran en la zona. Aunque Sonic logra abrirse paso y llegar hasta Eggman, se activa accidentalmente el Chaos Control, teletransportando a todos los que allí estaban del Planeta Mobius al Planeta Tierra. Allí, Sonic conoce a un joven de nombre Chris quien hospeda a los distintos personajes en su hogar. Sonic y sus amigos tendrán que seguir deteniendo a Eggman, el cual planea conquistar el recién descubierto mundo. En la segunda parte de la serie (Temporada 3), nos sitúa en su planeta de origen Mobius y la invasíon de la raza desconocida llamada Metarex, Sonic y compañía viajaran alrededor de diferentes planetas en un universo paralelo para detenerlos